Ярославская железная дорога сыграла огромную роль в Великой Отечественной войне. 4.5 тысячи железнодорожников ушли на фронт. Их заменили женщины. Предприятия Ярославской железной дороги непосредственно военную продукцию не производили, но значение транспорта в войне трудно переоценить. От бесперебойной работы железной дороги зависел успех военных действий на Карельском, Ленинградском, Северо-западном, Калининском, Прибалтийском, Западном, Белорусском фронтах. С северных портов Мурманска и Архангельска приходила военная помощь от других стран. Из Сибири и Дальнего Востока шли эшелоны с солдатами, вооружением, продовольствием на Москву, Ленинград и на все фронта. Из Ленинграда вывозили блокадников.
Ярославские железнодорожники за все годы войны погрузили, разгрузили, обработали и пропустили транзитом более 6 миллионов вагонов с оборудованием, сырьем, военной продукцией, людьми и т. д.
Под постоянным прицелом фашистской авиации находилась железная дорога. Только за октябрь 1941 года на нее было совершенно 110 групповых и одиночных налетов. Фашисты к 7 ноября сделали «подарок» - разбомбили Московский вокзал в Ярославле и железнодорожные пути. А это – узловая станция. Бомбили часто и на Всполье (сейчас это вокзал Ярославль Главный). По области было разрушено 69 станций и вокзалов, 15 километров путей. Кроме того, осенью 1941 года, когда возникла опасность захвата фашистами нашей области, железнодорожники взорвали 46 мостов, сняли 90 километров железнодорожного полотна. Но даже в таких условиях железная дорога продолжала работать, спасая жизни людей и заводы. Например, Рыбинский завод авиационных двигателей был эвакуирован по железной дороге (понадобилось 2800 вагонов), а через несколько дней после эвакуации завода все корпуса завода были разбомблены фашистами.
Паровозоремонтный завод в войну работал, как и все, на пределе. За годы войны рабочие завода изготовили и передали фронту 873 паровоза, 7 бронепоездов, 36 бронепоездов отремонтировали. Более 800 трофейных вагонов отремонтировали и переоборудовали для работы на железных дорогах страны.
За трудовые подвиги во время войны орденами и медалями СССР было награждено более 700 ярославских железнодорожников.
